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 Cours Modilisation molucelaire

La modélisation moléculaire est un ensemble de techniques pour modéliser ou simuler le comportement de molécules. Elle est utilisée pour reconstruire la structure tridimensionnelle de molécules, en particulier en biologie structurale, à partir de données expérimentales comme la cristallographie aux rayons X. Elle permet aussi de simuler le comportement dynamique des molécules et leur mouvements internes. On l'utilise enfin pour concevoir de nouveaux médicaments.

1 Introduction De Modélisation moléculaire

Les méthodes quantiques

La méthode de Hückel

La mécanique moléculaire

Méthode de Hückel : Ethylène


Représentation des OM

Energie des OM


HOMO et LUMO

Charges atomiques

Méthode de Hückel : Hydrocarbures conjugués linéaires



Orbitales moléculaires




Cas où le nombre d'atomes est un multiple de 4


Structure de la méthylène-imine

 Composés carbonylés

Groupe méthyle

méthanal (formaldéhyde)

Niveaux d’énergie du méthanal

Indice de liaison π


Valeurs propres et fonctions propres d'un opérateur

Méthode de Hückel


Réactivité chimique

Approximation des orbitales frontières



Substitution électrophile aromatique




















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